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AG H?ppner

Projekte

Die Forschung der Arbeitsgruppe von Dr. H?ppner besch?ftigt sich mit strukturbiologischen Aspekten von Proteinen und der In-vitro-Charakterisierung von Proteasen. Ein besonderer Schwerpunkt liegt dabei auf den SPP/SPPL- Proteasen. Diese Proteasen schneiden ihre Substrate innerhalb der hydrophoben Bereiche der zellul?ren Membranen, da ihre aktiven Zentren in diesem Bereich lokalisiert sind. Die Enzyme weisen jedoch sowohl intrazellul?r als auch extrazellul?r hydrophile Dom?nen auf. Das Zusammenspiel dieser verschiedenen Dom?nen in Bezug auf Substraterkennung und Regulation aufzukl?ren ist unser vorrangiges Ziel.

3D Struktur der SPP/SPPL Proteasen

Hoeppner et al., FEBS, Oct2023, doi:10.1111/febs.16968
Für die SPP/SPPL-Familie in S?ugetieren sind experimentelle 3D-Strukturen derzeit nicht verfügbar. Die Erforschung dieser Proteasen stützt sich daher noch ausschlie?lich auf KI-generierte Vorhersagen. Um ihre einzigartigen Merkmale zu verstehen, ist die Aufkl?rung der strukturellen Details von SPP/SPPL-Proteasen daher entscheidend. Zudem bildet die Kenntnis experimentell ermittelter hochaufl?sender 3D-Strukturen die Grundlage für strukturbasierte Wirkstoffentwicklung und für ein umfassendes Verst?ndnis der Substraterkennung und Spaltungsmechanismen. Zukünftig soll durch die Kenntnis der 3D-Strukturen die Identifizierung von Substraten erleichtert und ein umfassender Einblick in die molekularen Spaltmechanismen sowie die physiologischen Funktionen dieser Protease-Familie erm?glicht werden.

In-vitro-Charakterisierung der SPP/SPPL-Proteasen

Die Vertreter der SPP/SPPL-Proteasefamilie sind intramembrane Aspartylproteasen, die ?hnlich den Presinilinen ihre Transmembransubstrate innerhalb der hydrophoben Membranbereiche spalten, und sind in verschiedene pathophysiologische Prozesse involviert. Die Identifizierung von Substraten und das Verst?ndnis der Spaltmechanismen stellt jedoch eine gro?e Herausforderung dar.

Unser Ziel ist es daher, Assay-Systeme zu entwickeln, die eine In-vitro-Charakterisierung der SPP/SPPL-Proteasen zulassen und eine uneingeschr?nkte Untersuchung von Substraterkennung und enzymatischer Kinetik erm?glichen. Diese Assay-Systeme werden künftig zur Identifizierung von Komplexpartnern, der Best?tigung von Substraten, Mutagenese-Studien und der Charakterisierung von Inhibitoren beitragen. Dadurch k?nnen komplexe molekulare Interaktionen entschlüsselt, die Arzneimittelentwicklung vorangetrieben und das umfassende Verst?ndnis von Enzymfunktionen in einer kontrollierten Umgebung gef?rdert werden.

Forschungsf?rderung

Intramurale Forschungsf?rderung, Projektf?rderung, 新万博体育下载_万博体育app【投注官网】izinische Fakult?t der Universit?t Augsburg – F?rderung seit 2023

Publikationen

2024 | 2023 | 2009 | 2006 | 2005

2024

Sharrouf Kinda, Schlosser Christine, Mildenberger Sandra, Fluhrer Regina, Hoeppner Sabine. In vitro cleavage of tumor necrosis factor α (TNFα) by Signal-Peptide-Peptidase-like 2b (SPPL2b) resembles mechanistic principles observed in the cellular context. https://doi.org/10.1016/j.cbi.2024.111006
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2023

Hoeppner Sabine, Schr?der Bernd, Fluhrer Regina. Structure and function of SPP/SPPL proteases: insights from biochemical evidence and predictive modeling. https://doi.org/10.1111/febs.16968
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2009

Godemann Robert, Madden James, Kr?mer Joachim, Smith Myron, Fritz Ulrike, Hesterkamp Thomas, Barker John, H?ppner Sabine, Hallett David, Cesura Andrea, Ebneth Andreas, Kemp John. Fragment-based discovery of BACE1 inhibitors using functional assays. https://doi.org/10.1021/bi901061a
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2006

Larivière Laurent, Geiger Sebastian, Hoeppner Sabine, R?ther Susanne, Str??er Katja, Cramer Patrick. Structure and TBP binding of the 新万博体育下载_万博体育app【投注官网】iator head subcomplex 新万博体育下载_万博体育app【投注官网】8–新万博体育下载_万博体育app【投注官网】18–新万博体育下载_万博体育app【投注官网】20. https://doi.org/10.1038/nsmb1143
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2005

Baumli Sonja, Hoeppner Sabine, Cramer Patrick. A conserved mediator hinge revealed in the structure of the MED7·MED21 (新万博体育下载_万博体育app【投注官网】7·Srb7) heterodimer. https://doi.org/10.1074/jbc.m413466200
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Meinhart Anton, Kamenski Tomislav, Hoeppner Sabine, Baumli Sonja, Cramer Patrick. A structural perspective of CTD function. https://doi.org/10.1101/gad.1318105
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Hoeppner Sabine, Baumli Sonja, Cramer Patrick. Structure of the 新万博体育下载_万博体育app【投注官网】iator subunit cyclin C and its implications for CDK8 function. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2005.05.041
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H?ppner Christoph, Carle Anna, Sivanesan Durga, Hoeppner Sabine, Baron Christian. The putative lytic transglycosylase VirB1 from Brucella suis interacts with the type IV secretion system core components VirB8, VirB9 and VirB11. https://doi.org/10.1099/mic.0.28326-0
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